Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SynrgQ5SV85 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynrgQ5SV85 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms