Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQX6

Cyfip2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip2Q5SQX6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyfip2Q5SQX6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyfip2Q5SQX6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyfip2Q5SQX6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyfip2Q5SQX6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyfip2Q5SQX6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyfip2Q5SQX6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyfip2Q5SQX6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyfip2Q5SQX6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyfip2Q5SQX6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyfip2Q5SQX6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyfip2Q5SQX6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyfip2Q5SQX6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyfip2Q5SQX6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyfip2Q5SQX6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyfip2Q5SQX6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyfip2Q5SQX6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyfip2Q5SQX6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyfip2Q5SQX6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyfip2Q5SQX6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyfip2Q5SQX6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyfip2Q5SQX6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyfip2Q5SQX6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms