Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna2d4Q5RJF7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna2d4Q5RJF7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms