Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1td1Q587J6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
L1td1Q587J6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1td1Q587J6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1td1Q587J6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1td1Q587J6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1td1Q587J6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1td1Q587J6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1td1Q587J6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1td1Q587J6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1td1Q587J6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1td1Q587J6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1td1Q587J6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1td1Q587J6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms