Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm28047Q3US59 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm28047Q3US59 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm28047Q3US59 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm28047Q3US59 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm28047Q3US59 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm28047Q3US59 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm28047Q3US59 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm28047Q3US59 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm28047Q3US59 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm28047Q3US59 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm28047Q3US59 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm28047Q3US59 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm28047Q3US59 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm28047Q3US59 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm28047Q3US59 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm28047Q3US59 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm28047Q3US59 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm28047Q3US59 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm28047Q3US59 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms