Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms