Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB5

Smcr8, Guanine nucleotide exchange protein SMCR8, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smcr8Q3UMB5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smcr8Q3UMB5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smcr8Q3UMB5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms