Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx27Q3UHD6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx27Q3UHD6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.5 ms