Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccndbp1Q3TVC7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccndbp1Q3TVC7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccndbp1Q3TVC7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccndbp1Q3TVC7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccndbp1Q3TVC7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccndbp1Q3TVC7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccndbp1Q3TVC7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccndbp1Q3TVC7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccndbp1Q3TVC7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccndbp1Q3TVC7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccndbp1Q3TVC7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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