Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt2Q3TTY5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt2Q3TTY5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms