Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNH5

Fam172a, Protein FAM172A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam172aQ3TNH5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam172aQ3TNH5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms