Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc102aQ3TMW1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc102aQ3TMW1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms