Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf3c3Q3TMP1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms