Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp39Q3TIX9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp39Q3TIX9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp39Q3TIX9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp39Q3TIX9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp39Q3TIX9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp39Q3TIX9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp39Q3TIX9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp39Q3TIX9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp39Q3TIX9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp39Q3TIX9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp39Q3TIX9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms