Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RubcnlQ3TD16 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms