Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnfaip8l3Q3TBL6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms