Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm1123Q1RME4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm1123Q1RME4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms