Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpusd2Q149F1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rpusd2Q149F1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
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