Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp2b3Q0VF55 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp2b3Q0VF55 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms