Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem52bQ0VBF2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms