Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrstQ06666 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrstQ06666 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SrstQ06666 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrstQ06666 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SrstQ06666 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrstQ06666 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrstQ06666 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms