Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Thbs2Q03350 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Thbs2Q03350 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms