Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmp11Q02853 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms