Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb5Q02739 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb5Q02739 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb5Q02739 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms