Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkcqQ02111 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcqQ02111 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms