Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
F8a1Q00558 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
F8a1Q00558 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
F8a1Q00558 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms