Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gabpb1Q00420 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms