Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gjb6P70689 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb6P70689 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms