Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sycp3P70281 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sycp3P70281 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms