Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vamp7P70280 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vamp7P70280 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms