Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rad54lP70270 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad54lP70270 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms