Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Plxna3P70208 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms