Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhobP62746 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhobP62746 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhobP62746 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhobP62746 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhobP62746 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RhobP62746 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhobP62746 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhobP62746 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhobP62746 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RhobP62746 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhobP62746 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhobP62746 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhobP62746 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhobP62746 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhobP62746 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhobP62746 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhobP62746 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhobP62746 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhobP62746 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RhobP62746 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RhobP62746 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RhobP62746 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RhobP62746 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RhobP62746 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RhobP62746 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhobP62746 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RhobP62746 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhobP62746 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhobP62746 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhobP62746 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhobP62746 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhobP62746 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhobP62746 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhobP62746 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhobP62746 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhobP62746 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhobP62746 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhobP62746 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhobP62746 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhobP62746 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RhobP62746 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhobP62746 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhobP62746 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhobP62746 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhobP62746 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhobP62746 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhobP62746 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhobP62746 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhobP62746 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhobP62746 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhobP62746 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhobP62746 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhobP62746 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhobP62746 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhobP62746 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhobP62746 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhobP62746 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhobP62746 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhobP62746 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhobP62746 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhobP62746 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhobP62746 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhobP62746 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhobP62746 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhobP62746 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhobP62746 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhobP62746 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RhobP62746 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhobP62746 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RhobP62746 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhobP62746 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhobP62746 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RhobP62746 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RhobP62746 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RhobP62746 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RhobP62746 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhobP62746 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhobP62746 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhobP62746 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhobP62746 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhobP62746 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhobP62746 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhobP62746 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhobP62746 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhobP62746 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhobP62746 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhobP62746 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhobP62746 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhobP62746 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhobP62746 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhobP62746 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhobP62746 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhobP62746 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhobP62746 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhobP62746 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhobP62746 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhobP62746 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhobP62746 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhobP62746 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms