Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme3P61290 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme3P61290 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme3P61290 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme3P61290 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psme3P61290 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psme3P61290 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme3P61290 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme3P61290 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme3P61290 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme3P61290 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme3P61290 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme3P61290 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme3P61290 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.2 ms