Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcmtd1P59913 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcmtd1P59913 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms