Protein–RNA interactions for Protein: P59113

Fermt1, Fermitin family homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt1P59113 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Fermt1P59113 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fermt1P59113 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Fermt1P59113 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fermt1P59113 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fermt1P59113 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fermt1P59113 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fermt1P59113 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fermt1P59113 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fermt1P59113 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fermt1P59113 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fermt1P59113 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fermt1P59113 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fermt1P59113 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fermt1P59113 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fermt1P59113 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fermt1P59113 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fermt1P59113 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fermt1P59113 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms