Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdrg1P59048 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdrg1P59048 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdrg1P59048 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdrg1P59048 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms