Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Aqp4P55088 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms