Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nub1P54729 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nub1P54729 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nub1P54729 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nub1P54729 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nub1P54729 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nub1P54729 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nub1P54729 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nub1P54729 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nub1P54729 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nub1P54729 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms