Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CebpaP53566 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CebpaP53566 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CebpaP53566 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CebpaP53566 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CebpaP53566 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CebpaP53566 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CebpaP53566 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CebpaP53566 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CebpaP53566 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms