Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2e1P52482 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e1P52482 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms