Protein–RNA interactions for Protein: P51954

Nek1, Serine/threonine-protein kinase Nek1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek1P51954 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek1P51954 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek1P51954 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek1P51954 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nek1P51954 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek1P51954 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek1P51954 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek1P51954 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek1P51954 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek1P51954 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek1P51954 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek1P51954 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek1P51954 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek1P51954 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek1P51954 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek1P51954 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek1P51954 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek1P51954 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek1P51954 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek1P51954 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek1P51954 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek1P51954 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek1P51954 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek1P51954 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek1P51954 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms