Protein–RNA interactions for Protein: P51791

Clcn3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn3P51791 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clcn3P51791 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcn3P51791 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms