Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ItgavP43406 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ItgavP43406 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ItgavP43406 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ItgavP43406 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ItgavP43406 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ItgavP43406 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ItgavP43406 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItgavP43406 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgavP43406 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ItgavP43406 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ItgavP43406 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ItgavP43406 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms