Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ighmbp2P40694 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ighmbp2P40694 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms