Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn1P35821 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms