Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd28P31041 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd28P31041 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd28P31041 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd28P31041 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd28P31041 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd28P31041 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd28P31041 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd28P31041 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms