Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Marcksl1P28667 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Marcksl1P28667 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms