Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xrcc5P27641 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xrcc5P27641 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xrcc5P27641 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xrcc5P27641 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Xrcc5P27641 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xrcc5P27641 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xrcc5P27641 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xrcc5P27641 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xrcc5P27641 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Xrcc5P27641 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms