Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NdnP25233 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NdnP25233 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NdnP25233 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NdnP25233 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NdnP25233 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NdnP25233 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NdnP25233 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NdnP25233 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NdnP25233 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NdnP25233 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NdnP25233 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NdnP25233 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NdnP25233 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NdnP25233 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NdnP25233 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NdnP25233 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NdnP25233 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NdnP25233 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NdnP25233 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NdnP25233 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NdnP25233 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NdnP25233 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NdnP25233 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NdnP25233 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NdnP25233 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NdnP25233 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NdnP25233 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NdnP25233 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NdnP25233 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NdnP25233 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NdnP25233 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NdnP25233 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NdnP25233 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NdnP25233 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NdnP25233 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NdnP25233 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NdnP25233 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NdnP25233 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NdnP25233 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NdnP25233 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NdnP25233 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NdnP25233 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NdnP25233 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NdnP25233 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NdnP25233 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NdnP25233 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NdnP25233 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NdnP25233 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NdnP25233 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NdnP25233 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NdnP25233 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NdnP25233 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NdnP25233 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NdnP25233 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NdnP25233 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NdnP25233 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NdnP25233 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NdnP25233 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NdnP25233 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NdnP25233 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NdnP25233 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NdnP25233 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NdnP25233 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NdnP25233 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NdnP25233 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NdnP25233 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NdnP25233 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NdnP25233 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NdnP25233 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NdnP25233 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NdnP25233 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NdnP25233 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NdnP25233 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NdnP25233 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NdnP25233 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NdnP25233 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NdnP25233 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NdnP25233 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NdnP25233 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NdnP25233 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NdnP25233 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NdnP25233 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NdnP25233 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NdnP25233 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NdnP25233 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NdnP25233 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NdnP25233 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NdnP25233 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NdnP25233 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NdnP25233 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NdnP25233 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NdnP25233 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NdnP25233 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NdnP25233 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NdnP25233 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NdnP25233 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NdnP25233 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NdnP25233 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NdnP25233 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms